Cependant même si la plupart des chrétiens d'Orient croient que c’est le véritable lieu d'enterrement de la mère de Jésus, personne ne prétend que ses restes sont toujours là-bas. Selon la tradition chrétienne, Marie est montée au ciel sous une forme corporelle. Mais bien que les catholiques croient que la Vierge n’a jamais été morte, les chrétiens d'Orient affirment qu’elle a vraiment été morte, enterrée et n’est montée au ciel qu’après sa résurrection le troisième jour - comme son fils, Jésus.
Ainsi que l’Église du Saint-Sépulcre, où Jésus aurait été enterré, l’Église du Sépulcre de Marie a été initialement construite à l'époque du roi Constantin I au quatrième ciècle après J.-C. Le lieu saint a été détruit par la suite et reconstruit à plusieurs reprises au cours des siècles. La structure actuelle a été construite par les Frères franciscains au cours de la deuxième moitié du 14e siècle. C’est l’Église grecque orthodoxe qui est en possession du complexe, mais elle partage certains droits de son utilisation avec d'autres confessions chrétiennes. Les musulmans qui vénèrent également Marie, ont un lieu spécial de prière dans le bâtiment, marqué par le mihrab (une niche creusée dans le mur) qui désigne la direction de La Mecque.
Le tombeau de Marie qui se trouve dans la profondeur sous l’église cruciforme, en bas de l'escalier du 12e siècle, est flanqué de la chapelle St-Joseph (le mari de Marie) d’un côté et d’une chapelle dédiée aux parents de la Vierge d’un autre. Les visiteurs doivent se pencher pour entrer dans la crypte, où ils sont accueillis par un brillant étalage des icônes et des objets d’art médiéval. A l’intérieur les pèlerins prient et allument les bougies, conférant à l’endroit une profonde aura de paix et de vénération.
