מייסדו ומנהלו הראשון היה אברהם מנדאל ז"ל, שניהל אותו בשנים 1964 עד 1995. החל בשנת 1995 מנהלת את המוזיאון מירה דרור. לאחר פינוי בית הנהלת המכס בשנת 2006, נקבע משכנו החדש של המוזיאון בבניין כי"ח שברחוב אגריפס 42 בירושלים. במקום נערכו עבודות לרענון התצוגה ושינויה תוך שימוש בטכנולוגיות חדישות. המוזאון הינו יחיד במינו בנוף המוזיאונים, ובו מוצגת ההיסטוריה של ארץ-ישראל בהיבט של המסים.
במוזיאון מוצגים, בין היתר, מסמכים, תעודות, תצלומים ומוצגים אחרים על הנושאים: המיסים בעולם הקדום ובמקורות העבריים, מיסים ממלכתיים בקהילות היהודים בתפוצות, המסים שנהגו בארץ ישראל בתקופה העות'מאנית, בתקופת המנדט הבריטי ומאז קום המדינה, אמצעי סימון להוכחת תשלום מסים מניעת הברחות ומניעת יבואם של טובין אסורים, ומסים במדינות שונות. בין השאר, במוזיאון תצוגה של מכתבים שכתבו אישים מפורסמים בפניות לרשויות המסים, ביניהם דוד בן-גוריון, יצחק בן-צבי, לאה גולדברג וזאב וילנאי. בנוסף, במוזאון ריכוז של חומר עיוני וחזותי רב על התפתחות המסים באזורנו וברחבי העולם, המשמש לפעולות מחקר ועיון בנושא המסים לסטודנטים וחוקרים.
יש לתאם את הביקור במוזיאון בטלפונים: 02-6257597, 02-5317332
