למבקר במרכז צפויה חוויה רוחנית וחזותית תרבותית ואומנותית. האווירה בו משמרת את אופיו המקורי והעתיק של הבניין, המועצמת בגן אנדלוסי מרהיב ובאמנות המרוקאית-המורית, בסגנון ארמון אלהמברה בגרנדה. הקמת מרכז המורשת בירושלים, נועדה לשמר, ללמד, לטפח, ולהעמיק בקרב דור ההמשך את תרבותם ומורשתם של יהודי צפון אפריקה בארץ ובעולם. המרכז ממוקם בליבה של שכונת מחנה-ישראל, שנוסדה בשנת 1865 במבנה העתיק ביותר בשכונה אשר שימש בעבר ככולל לעדה המערבי, בית מחסה, בית מדרש ובית-כנסת.
המקום עוצב על ידי אמנים שהגיעו במיוחד ממרוקו, על פי הנחיותיו של האדריכל אלי מויאל ממרקש, ובפיקוחו האמנותי של האמן דוד סוזנה. המרכז הוכרז כאתר היסטורי ואדריכלי. כיום משמש המבנה כמרכז תרבות ומורשת ובו אולמות תצוגה מרהיבים בהם מוצגות תערוכות זמניות וקבועות בתחומי האמנות, בהצגת פריטים ייחודיים וכן בהצגת תמונות מחיי הקהילות היהודיות בצפון אפריקה.
במרכז קיימת ספרייה עיונית עשירה ובה כתבים מקוריים, מחקרים וספרי עיון, ובה נערכות סדנאות לימוד בתחומי מורשת יהדות צפון אפריקה, בשילוב עם מוסדות אקדמיים. בנוסף מתקיימות פעילויות שונות, ערבי ספרות ועיון, ערבי שירה ופיוט, חוגים ללימוד נגינה, הרצאות, הדרכה, חוגים בפיוט וחזנות, ועוד.
המוזיאון מציע סיורים בימים שני, שלישי ורביעי, בשעה 11:00 בתיאום ורכישה מראש. משך כל סיור כשעה ובעלות של 25ש"ח למשתתף.